从2001年在全国率先实施香菇标准化生产后，近年来，庆元县又推行了“菌棒生产工厂化、栽培管理基地化”新模式，扶持建成菌棒工厂化生产厂76家，实现菌棒工厂化生产全覆盖，建成松源食用菌示范区、东瓜源食用菌标准化生产基地、蔡段食用菌集约化生产基地、庆元县食用菌标准园等标准化生产基地村87个，出口备案基地32个。随着“五水共治”、“六边三化三美”工作推进，庆元县推广钢架标准菇棚，至2016年底全县新建改造标准菇棚50.41万平方米。通过深化食用菌标准化生产，强化种植基地规范化管理，2013年庆元县出口食用菌质量安全示范区被评为国家级出口食品农产品质量安全示范区。2016年获全国优秀出口香菇基地县，食用菌出口额2525万美元。目前，庆元县食用菌行业拥有有机产品45个，无公害产品4个，无公害产地4个，绿色食品6个。