近年来，台州市紧扣“五水共治 治污先行”工作主线，坚决打好畜牧业转型升级攻坚战，通过开展畜禽养殖污染整治，全市农村生态环境得到明显改善。截至目前，该市规模养殖场已全面完成整治，共关停规模养殖场3812家，改造提升778家，建成美丽示范牧场19家，实现了分散养殖向规模养殖的转变。
精准发力全面细“治”
　　走进台州临海春法畜牧公司，几乎闻不到臭味，所有猪粪尿都通过下水道直通沼气池，保证污水不会外泄。“污物不外排是宗旨。”企业负责人林春法说，“我们原来年出栏两万头肉猪，为达到生态标准，现在年计划出栏一万头。”
　　在进行畜牧业整治时，台州根据养殖规模、畜禽品种的不同，做了非常细致的分类，对症下药:对存栏50头以上的规模养殖场，按“两分离三配套(雨污分离、干湿分离，配套建设沼气池、沼液贮存池、干粪堆积池)”要求进行生态治理；对存栏1500羽以上的规模水禽场，按照“鸭不出圈、污不入河”的要求，采取生态消纳和网上养殖等多种模式，实施离河、离岸养殖，无法治理的予以关停；对存栏50头以下的散养户，符合远离河道、学校、医院等聚集区要求并自愿整改的，参照50头以上的标准，按照栅格式简便有效方式进行建设，无法整改的一律关停。目前，全市规模养殖场已全部完成整治，共关停3812家，保留834家；排查的452家规模水禽场全部完成治理。
　　目前，台州全市均已建立“县-镇（街道）-村”三级网格化巡查机制，农业、环保、乡镇均逐场落实技术指导人员、监管人员、巡查人员，对不符合条件的养殖场（户），不安排畜牧业项目扶持资金，责令其限期整改，情节严重的予以关停。在此基础上，各地采取不同方式，全方位加强监管力度。
对症下药破解难题
　　针对农户散养土猪这一实际，台州实施了“人畜分离”政策，在村子边上建立“集体宿舍”提供给想继续养猪的村民，使村庄环境大为改观。
　　仙居县白塔镇上横街村外有一个“仙猪公寓”，这里养了30多头猪，属于村里不同的村民。“村里每家每户的猪舍都拆掉了，在村外建了集中猪舍，起了个好听的名字叫‘仙猪公寓’，同时配套建设治污设施，沼液肥料用来种菜。”村里负责人介绍说，这样不仅让村民能养猪，也解决了污染问题。目前，全县已拆除6万多个散养猪舍，建成“仙猪公寓”225个，面积71814.63平方米。
　　划分禁限养区后，禁限养区内原有养殖场面临关停、发展受限的难题，椒江区新建了生态奶牛园区，将面临整治关停的奶牛养殖户搬迁至园区，新建牛舍8幢共计8800平方米，配有管理房、饲料站、生鲜乳收购站、粪便收集处理中心、污水一体化处理设备，实行统一集中饲养、统一供料、统一防疫、统一鲜奶销售、统一污水治理的“五统一”模式。目前，园区内奶牛存栏量已占到全区奶牛存栏量的70%，成为台州本地饲养规模最大的奶牛养殖园区，年向社会提供生鲜乳1575吨，销售收入787万元。
农牧结合标本兼治
　　位于天台县西部省级现代农业综合园区内森标生态养殖场，是一家生态循环农业种养结合“小循环”的典型。该养殖场推行适度规模经营，存栏生猪500头，同时在养殖场周围建立水果、蔬菜生产基地300多亩，每天消纳养殖场近6吨的粪便和污水。“通过种养结合不仅从根本上解决了猪场排泄物的去向问题，也为果园提供了充足、优质的有机肥料，每年可节省化肥成本支出15万元左右。”业主施森标介绍。
　　养殖场围墙边，通出一些管子，向周边农田延伸，养殖场产生的沼液，通过这些管子无偿供应给周边种植户们使用。养殖场每年产生的沼液、沼渣、有机肥料可供应周边近3000亩农田使用。
　　台州采取“猪-沼-作物”循环模式，让畜禽养殖场与周边种植户签订排泄物利用协议，通过肥水还田、生产沼气、制造有机肥等方式开展综合利用，确保排泄物得到有效利用。目前全市已建成省级生态循环农业示范区11个、畜牧主导产业示范区3个、特色畜牧业精品园7个，在农业“两区”内配套建设畜禽养殖场181家。对排泄物不能就地消纳的规模养殖场，根据其现有的畜禽存栏量和种植基地现状，由中介公司运输沼液至对接消纳基地进行生态消纳。
无害化处理保障安全
　 养殖业不可避免会产生病死动物，如果不妥善处理，又将会造成污染，并且危及“舌尖安全”。
　　椒江区病死动物无害化处理中心位于三甲街道十塘区块，由4个独立区域组成，分别为死亡动物高温灭菌熟化车间、生物处理车间、种蝇车间和有机肥生产车间，采取湿法化制生物转化法，运用湿化加发酵的处理工艺，将动物尸体转化为有机肥。
　　截至目前，台州已建成并运行病死动物无害化处理中心5座，有5个县（市、区）已建立生猪保险与无害化处理联动机制，有效防止动物疫情扩散传播，从源头上遏制病死动物及其产品流向市场。2016年台州市印发了《关于推进全市死亡动物跨区域联动处理机制建设工作的通知》，积极推动尚未建设无害化处理中心的县（区）委托已建成的无害化处理中心处理死亡动物。目前玉环县已与温岭市签订委托处理协议。2015年至今，全市共无害化处理病死猪26.86万头，其中集中处理厂处理9.91万头。技术人员给鸡注射疫苗。