嫁接西瓜苗一般在3月中下旬起易发生根腐病“凋萎”，到4月中旬西瓜开花坐果时加重。有的瓜苗砧木根茎部维管束有褐变，有的根茎部嫁接口有异常膨大或产生“卡脖子”、“穿根”现象。
　　引起嫁接西瓜苗根腐病凋萎有四方面原因：一是与前茬作物和土壤有极大的关系。前作为水稻或茭白田，地势低洼，土壤较为粘湿，地下水位较高，不利于根系生长。二是与气候条件有关。春季低温阴雨、弱光天气多，排水不畅，容易引起凋萎，气温的忽高忽低使情况更加严重。三是与砧木品种的抗性有关。四是与嫁接方法不当引起“卡脖子”及“穿根”引起枯萎病有关。
　　防治嫁接西瓜苗枯萎可采取以下办法：一是西瓜地宜选择地势高躁、排水条件好的地块。地势低洼、排水不畅、容易积水、土壤粘重的地块不宜种植嫁接西瓜。二是创造有利于西瓜生长的环境条件，增强植株抗性。三是化学防治。一旦发生嫁接西瓜凋萎症状，要及时采用多菌灵、代森锰锌、乙磷铝等进行灌根,并暂时中止坐瓜，少整枝，喷施低浓度叶面肥，防止凋萎加剧，减少损失。